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TruSeq Stranded mRNA文庫(kù)制備(48樣本)測(cè)序
TruSeq Stranded mRNA文庫(kù)制備(48樣本)測(cè)序先前稱為TruSeq Stranded mRNA文庫(kù)制備試劑盒(目錄號(hào)RS-122-2101,RS-122-2102和RS-122-2103)的產(chǎn)物現(xiàn)稱為TruSeq Stranded mRNA。產(chǎn)品配置已更改。在新配置中,庫(kù)準(zhǔn)備和索引適配器可以單獨(dú)購(gòu)買。
產(chǎn)品名稱:TruSeq Stranded mRNA Library Prep (48 Samples)
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產(chǎn)品貨號(hào):20020594(ssv21106)
產(chǎn)品規(guī)格:
分析時(shí)間 ~10.5小時(shí)
動(dòng)手時(shí)間 ~4.5小時(shí)
輸入數(shù)量 0.1 - 1 ug總RNA或10 - 100 ng以前分離的mRNA(來(lái)自具有polyA尾的物種)
內(nèi)容規(guī)格 用鏈信息捕獲編碼轉(zhuǎn)錄組
行動(dòng)機(jī)制 Oligo-dT珠子捕獲polyA尾巴
復(fù) 1-96
描述 通過(guò)精確的鏈信息為研究人員提供清晰,全面的編碼轉(zhuǎn)錄組視圖。
專業(yè)樣品類型 不兼容FFPE
物種詳情 使用來(lái)自任何具有polyA尾巴的物種的高質(zhì)量RNA
系統(tǒng)兼容性 Genome Analyzer IIx,HiSeq 1000,HiSeq 1500,HiSeq 2000,HiSeq 2500,HiSeq 3000,HiSeq 4000,MiSeq,NextSeq 500,NextSeq 550,NovaSeq 6000
變體類 基因融合,新型轉(zhuǎn)錄本,單核苷酸多態(tài)性(SNPs),轉(zhuǎn)錄變體
物種類別 哺乳動(dòng)物,大鼠,人類,牛,老鼠
核酸類型 RNA
技術(shù) 測(cè)序
方法 mRNA測(cè)序
線條特異性 擱淺
產(chǎn)品名稱:TruSeq Stranded mRNA文庫(kù)制備(48樣本)測(cè)序 產(chǎn)品貨號(hào):20020594(ssv21106)
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產(chǎn)品介紹:TruSeq Stranded mRNA為編碼轉(zhuǎn)錄組分析提供了簡(jiǎn)化,經(jīng)濟(jì)高效且可擴(kuò)展的解決方案。它與各種樣品兼容。
鋼絞線方向檢測(cè)
獲得mRNA鏈方向的精確測(cè)量,用于檢測(cè)反義轉(zhuǎn)錄,增強(qiáng)的轉(zhuǎn)錄物注釋和增加的比對(duì)效率。高覆蓋度均勻性增強(qiáng)了諸如替代轉(zhuǎn)錄物,基因融合和等位基因特異性表達(dá)等特征的發(fā)現(xiàn)。
成本效益
鏈狀信息識(shí)別來(lái)自給定RNA轉(zhuǎn)錄物的2條DNA鏈中的哪一條。該信息提供了對(duì)轉(zhuǎn)錄物注釋的增強(qiáng)的置信度,特別是對(duì)于非人類樣品。鑒定鏈來(lái)源增加了比對(duì)的讀數(shù)百分比,降低了每個(gè)樣品的測(cè)序成本。
可擴(kuò)展
該工作流程可以對(duì)標(biāo)準(zhǔn)樣品和低質(zhì)量樣品進(jìn)行可靠的詢問(wèn),并且工作流程與各種研究設(shè)計(jì)兼容。
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文庫(kù)制備
品牌 產(chǎn)品貨號(hào) 產(chǎn)品名稱
illumina品牌 20020594 TruSeq® Stranded mRNA Library Prep (48 Samples)文庫(kù)制備
illumina品牌 20020595 TruSeq® Stranded mRNA Library Prep (96 Samples)文庫(kù)制備
引物接頭
品牌 產(chǎn)品貨號(hào) 產(chǎn)品名稱
illumina品牌 20020492 TruSeq® RNA Single Indexes Set A (12 Indexes, 48 Samples)引物接頭
illumina品牌 20020493 TruSeq® RNA Single Indexes Set B (12 Indexes, 48 Samples)引物接頭
illumina品牌 20019792 TruSeq RNA CD Index Plate (96 Indexes, 96 Samples)引物接頭
illumina品牌 20020591 IDT for Illumina-TruSeq RNA UD Indexes (24 Indexes, 96 Samples)引物接頭
illumina品牌 20022371 IDT for Illumina-TruSeq RNA UD Indexes (96 Indexes, 96 Samples)引物接頭
配件產(chǎn)品
品牌 產(chǎn)品貨號(hào) 產(chǎn)品名稱
illumina品牌 20024144 Illumina® Free Adapter Blocking Reagent (12 reactions)配件產(chǎn)品
illumina品牌 20024145 Illumina® Free Adapter Blocking Reagent (48 reactions)配件產(chǎn)品
文庫(kù)制備試劑盒
品牌 產(chǎn)品貨號(hào) 產(chǎn)品名稱
illumina品牌 RS-122-2101 TruSeq Stranded mRNA Library Preparation Kit Set A (48 samples, 12 indexes)文庫(kù)制備試劑盒
illumina品牌 RS-122-2102 TruSeq Stranded mRNA Library Preparation Kit Set B (48 samples, 12 indexes)文庫(kù)制備試劑盒
illumina品牌 RS-122-2103 TruSeq Stranded mRNA Library Prep Kit High Throughput (96 samples, 96 indexes)文庫(kù)制備試劑盒
Illumina二代測(cè)序技術(shù),邊合成邊測(cè)序(SBS),是廣泛采用的新一代測(cè)序(NGS)技術(shù),負(fù)責(zé)產(chǎn)生世界上90%以上的測(cè)序數(shù)據(jù)。
Illumina的二代測(cè)序技術(shù)稱為邊合成邊測(cè)序(Sequencing-by-Synthesis,簡(jiǎn)稱SBS)。SBS主要包括堿基延伸、熒光激發(fā)及信號(hào)收集、剪切等3個(gè)步驟。這3個(gè)步驟可以重復(fù),循環(huán)進(jìn)行。每循環(huán)一次測(cè)定一個(gè)堿基。想測(cè)定多少個(gè)堿基(即讀長(zhǎng)),就循環(huán)多少次。測(cè)序循環(huán)次數(shù)可以在軟件里設(shè)定。到底測(cè)序多長(zhǎng)合適,要根據(jù)項(xiàng)目性質(zhì)和需求來(lái)決定。大多數(shù)情況下,SR實(shí)驗(yàn)(單端測(cè)序)測(cè)定1x50個(gè)堿基,PE實(shí)驗(yàn)(雙端測(cè)序)測(cè)定2x150個(gè)堿基。
1 堿基延伸
Illumina測(cè)序試劑里所使用的dNTP特色,它們同時(shí)具有兩個(gè)修飾基團(tuán):一個(gè)熒光基團(tuán),一個(gè)可逆終止基團(tuán)。A、G、C、T 4種堿基分別標(biāo)記4種不同的熒光基團(tuán),它們?cè)诓煌ㄩL(zhǎng)的激光激發(fā)下,能夠發(fā)射不同波長(zhǎng)(即顏色)的熒光。熒光顏色與堿基種類一一對(duì)應(yīng),因此根據(jù)激發(fā)光的波長(zhǎng)可以識(shí)別堿基。4種堿基的終止基團(tuán)是一樣的。由于終止基團(tuán)的存在,所有dNTP每次都只能延伸1個(gè)堿基,無(wú)論給予多長(zhǎng)的反應(yīng)時(shí)間。又由于該終止基團(tuán)是可逆的,在熒光信號(hào)收集完畢之后,可以用剪切劑切除該終止基團(tuán),使堿基恢復(fù)自然的可延伸狀態(tài),這時(shí)即可繼續(xù)進(jìn)行下一輪循環(huán),再測(cè)定一個(gè)堿基。
可逆終止基團(tuán)技術(shù)是Illumina二代測(cè)序的一大特色。它與橋式PCR技術(shù)一起,構(gòu)成了Illumina二代測(cè)序的兩大支柱,為穩(wěn)定獲得高質(zhì)量的測(cè)序數(shù)據(jù)打下了堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)。
2 信號(hào)采集
HiSeq系列測(cè)序儀具有紅綠兩根激光管,兩個(gè)濾色片。它們兩兩組合,可以形成4種不同的激發(fā)波長(zhǎng),正好分別用于激發(fā)A、G、C、T 4種堿基。
Cluster上所標(biāo)記的熒光基團(tuán)在激光激發(fā)下產(chǎn)生的信號(hào),可以用相機(jī)拍攝或者掃描的方式收集信號(hào)。掃描技術(shù)速度比較快,被X10系列采用。由于FC面積比較大,而且上表面和下表面要分別拍照,所以拍照過(guò)程相當(dāng)耗時(shí)。對(duì)于經(jīng)典的HiSeq 2000來(lái)說(shuō),一次測(cè)序循環(huán)所產(chǎn)生的熒光信號(hào),需要大約40分鐘的時(shí)間才能拍照收集完畢,時(shí)間比測(cè)序反應(yīng)本身還要長(zhǎng)。
3 剪切
熒光信號(hào)收集完畢后,關(guān)閉激光,用剪切劑去除測(cè)序引物的延伸產(chǎn)物上的堿基所標(biāo)記的熒光基團(tuán)和終止基團(tuán)。兩個(gè)修飾基團(tuán)均被切除,一方面消去干擾熒光,一方面使鏈末端的堿基回復(fù)到自然的可延伸狀態(tài),為下一輪測(cè)序做好準(zhǔn)備。
再重復(fù)合成、激發(fā)、收集等步驟,即可進(jìn)行第二個(gè)堿基的測(cè)序。
測(cè)序循環(huán)可以重復(fù)多次。理論上可以一直重復(fù),直到信噪比降低得無(wú)法有效識(shí)別堿基信號(hào)為止。由于熒光基團(tuán)的發(fā)光效率持續(xù)不斷在衰減,Taq酶的活性也在持續(xù)不斷地衰減,所以實(shí)際上測(cè)序循環(huán)次數(shù)是有限的,大重復(fù)次數(shù)與sbs試劑的配方有關(guān)。測(cè)序的循環(huán)次數(shù)可以在軟件設(shè)置過(guò)程中人為,這個(gè)重復(fù)次數(shù)就是每個(gè)測(cè)序片段的讀長(zhǎng)。目前,Illumina平臺(tái)的讀長(zhǎng)有2x100 bp,2x125 bp,2x150 bp,2x300 bp等多種,其中2x150 bp用得較廣泛。
單端測(cè)序:?jiǎn)味藴y(cè)序(Single-read)首先將DNA樣本進(jìn)行片段化處理形成200-500bp的片段,引物序列連接到DNA片段的一端,然后末端加上接頭,將片段固定在flow cell上生成DNA簇,上機(jī)測(cè)序單端讀取序列。
雙端測(cè)序:雙端測(cè)序(Paired-end)方法是指在構(gòu)建待測(cè)DNA文庫(kù)時(shí)在兩端的接頭上都加上測(cè)序引物結(jié)合位點(diǎn),在*輪測(cè)序完成后,去除*輪測(cè)序的模板鏈,用對(duì)讀測(cè)序模塊(Paired-End Module)引導(dǎo)互補(bǔ)鏈在原位置再生和擴(kuò)增,以達(dá)到第二輪測(cè)序所用的模板量,進(jìn)行第二輪互補(bǔ)鏈的合成測(cè)序。
基因測(cè)序是一種新型基因檢測(cè)技術(shù),能夠從血液或唾液中分析測(cè)定基因全序列,預(yù)測(cè)罹患多種疾病的可能性,個(gè)體的行為特征及行為合理。基因測(cè)序技術(shù)能鎖定個(gè)人病變基因,提前預(yù)防和治療。
基因測(cè)序相關(guān)產(chǎn)品和技術(shù)已由實(shí)驗(yàn)室研究演變到臨床使用,可以說(shuō)基因測(cè)序技術(shù),是下一個(gè)改變世界的技術(shù) 。
基因測(cè)序只是基因檢測(cè)的方法之一,其又叫基因譜測(cè)序,是上*的一種基因檢測(cè)標(biāo)準(zhǔn)。
基因測(cè)序廣為人知的還有針對(duì)唐氏綜合征篩查的無(wú)創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測(cè)。只需要采集孕婦的外周血,通過(guò)對(duì)血液中游離DNA(包括胎兒游離DNA)進(jìn)行測(cè)序,并將測(cè)序結(jié)果進(jìn)行生物學(xué)分析,從而得出胎兒是否患有染色體數(shù)目異常的疾病,包括常見(jiàn)的21-三體綜合征(唐氏綜合征)、18-三體綜合征(愛(ài)德華氏綜合征)和13-三體綜合征(Patau綜合征)。
附推廣:illumina品牌—RNA相關(guān)產(chǎn)品:
品牌 產(chǎn)品貨號(hào) 產(chǎn)品名稱
illumina品牌 RS-200-1001 TruSeq RNA EPH Reagent Tube
illumina品牌 RS-303-1002 TruSight RNA Pan-Cancer Panel Set A
illumina品牌 RS-303-1003 TruSight RNA Pan-Cancer Panel Set B
illumina品牌 RS-304-1002 TruSight RNA Fusion Panel Set A (48 samples)
illumina品牌 RS-304-1003 TruSight RNA Fusion Panel Set B (48 samples)
illumina品牌 RT-101-1001 TruSeq Targeted RNA Custom Panel Kit (48 samples)
illumina品牌 RT-102-1001 TruSeq Targeted RNA Custom Panel Kit (96 samples)
illumina品牌 RT-201-1001 TruSeq Targeted RNA Neurodegeneration Panel Kit (48 samples)
illumina品牌 RT-201-1002 TruSeq Targeted RNA Hedgehog Panel Kit (48 samples)
illumina品牌 RT-201-1004 TruSeq Targeted RNA Wnt Panel Kit (48 samples)
illumina品牌 RT-201-1005 TruSeq Targeted RNA Stem Cell Panel Kit (48 samples)
illumina品牌 RT-201-1006 TruSeq Targeted RNA Cytochrome p450 Panel Kit (48 samples)
illumina品牌 RT-201-1007 TruSeq Targeted RNA p53 Panel Kit (48 samples)
illumina品牌 RT-201-1008 TruSeq Targeted RNA NFkB Panel Kit (48 samples)
illumina品牌 RT-201-1009 TruSeq Targeted RNA Cardiotoxicity Panel Kit (48 samples)
illumina品牌 RT-201-1010 TruSeq Targeted RNA Apoptosis Panel Kit (48 samples)
illumina品牌 RT-202-1001 TruSeq Targeted RNA Neurodegeneration Panel Kit (96 samples)
illumina品牌 RT-202-1002 TruSeq Targeted RNA Hedgehog Panel Kit (96 samples)
illumina品牌 RT-202-1004 TruSeq Targeted RNA Wnt Panel Kit (96 samples)
illumina品牌 RT-202-1005 TruSeq Targeted RNA Stem Cell Panel Kit (96 samples)
illumina品牌 RT-202-1006 TruSeq Targeted RNA Cytochrome p450 Panel Kit (96 samples)
illumina品牌 RT-202-1007 TruSeq Targeted RNA p53 Panel Kit (96 samples)
illumina品牌 RT-202-1008 TruSeq Targeted RNA NFkB Panel Kit (96 samples)
illumina品牌 RT-202-1009 TruSeq Targeted RNA Cardiotoxicity Panel Kit (96 samples)
illumina品牌 RT-202-1010 TruSeq Targeted RNA Apoptosis Panel Kit (96 samples)
illumina品牌 RT-801-1001 TruSeq Targeted RNA Supplemental Content Kit (48 samples)
illumina品牌 RT-802-1001 TruSeq Targeted RNA Supplemental Content Kit (96 samples)
illumina品牌 RZE1224 Ribo-Zero? rRNA Removal Regents (Epidemiology) 24 Reactions
illumina品牌 RZH110424 Ribo-Zero? rRNARemoval Kit (H/M/R) 24rxns
illumina品牌 RZHM11106 Ribo-ZeroTM Gold rRNA Removal Reagents (Human/Mouse/Rat)
illumina品牌 RZMB12324 Ribo-Zero? rRNA Removal Reagents (Bacteria) 24 Reactions
illumina品牌 RZNB1056 Ribo-Zero rRNA-Removal Reagents (Gram-Negative Bacteria) 6 Rxns
illumina品牌 RZPL11016 Ribo-Zero rRNA Removal Reagents (Plant Leaf) 6 Rxns
illumina品牌 RZSR11036 Ribo-Zero rRNA Removal Reagents (Plant Seed/Root) 6 Rxns
illumina品牌 T4RL2DML-X T4 RNA Ligase 2, Deltion Mutant-Bulk
illumina品牌 T7R100UML-X T7 RNA Polymerase (100 U/ul)-Bulk
illumina品牌 T7R1KUML-X T7 RNA Polymerase-Bulk; 1,000 U/ul
illumina品牌 T7R50UML-X T7 RNA Polymerase (50 U/ul) - Bulk
illumina品牌 TAB1R80524 TargetAmp 1-Round Biotin-aRNA Amplification Kit 105 24 Rxns
產(chǎn)品名稱:TruSeq Stranded mRNA文庫(kù)制備(48樣本)測(cè)序 產(chǎn)品貨號(hào):20020594(ssv21106)
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