人類血液是分子信息的豐富來(lái)源，可用于開發(fā)特定腫瘤和器官（例如胎盤）的非侵入性液體活檢，以預(yù)測(cè)疾病、其進(jìn)展和對(duì)治療的反應(yīng)。近年來(lái)，隨著微陣列和RNA測(cè)序（RNA-Seq）等技術(shù)的普及，全基因組轉(zhuǎn)錄組分析被應(yīng)用于發(fā)現(xiàn)分子標(biāo)記，這些技術(shù)允許同時(shí)測(cè)量數(shù)以萬(wàn)計(jì)的蛋白質(zhì)編碼和非蛋白質(zhì)。開發(fā)血液轉(zhuǎn)錄組標(biāo)記物以監(jiān)測(cè)整個(gè)懷孕期間的胎盤功能和產(chǎn)科并發(fā)癥的風(fēng)險(xiǎn)需要準(zhǔn)確量化基因表達(dá)。
來(lái)自美國(guó)韋恩大學(xué)醫(yī)學(xué)院和密歇根州立大學(xué)的研究團(tuán)隊(duì)在Nature子刊Scientific Reports發(fā)表了題為“Targeted expression profiling by RNA - Seq improves detection of cellular dynamics during pregnancy and identifies a role for T cells in term parturition"的文章，比較了在外顯子水平探測(cè)轉(zhuǎn)錄組的Affymetrix人類轉(zhuǎn)錄組陣列（HTA 2.0）、具有珠蛋白還原的配對(duì)末端Illumina RNA-Seq以及一種新型全基因組靶向表達(dá)分析技術(shù) DriverMap，評(píng)估了這些方法在母體全血中定量源自胎盤單細(xì)胞基因組的細(xì)胞類型特異性特征表達(dá)的能力，并確定了這些特征是否能表明足月分娩。
由于器官和/或細(xì)胞類型特異性轉(zhuǎn)錄本在全血中低表達(dá)，因此RNA的完整性、穩(wěn)定性和RNA的豐度定量對(duì)下游實(shí)驗(yàn)至關(guān)重要。本研究中使用的血液RNA采血管是PAXgene全血RNA管（BD，762165），該管中含有穩(wěn)定添加劑，可長(zhǎng)時(shí)間維持細(xì)胞 RNA 完整性。
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